治疗疾病，中医讲究“治病必求于本”，所以，当中医医生辨证得到了患者发病的根本病因病机之后，就会进行处方用药。但是，不同的疾病，它的病因病机有可能是相同的。比如这个病人是慢性胃炎，可能表现为肝气郁滞的症状，那么医生可能考虑给他用疏肝理气的方法。另一个病人，可能是肋间神经痛的患者，也可以表现为肝气郁滞的症状，医生也可能给他用疏肝理气的方法，既然方法相同，所用的处方可能完全一样，这就叫做“异病同治”。
如果说，胃痛和肋间神经痛，在部位上、症状上都有一定的类似之处，所用处方完全一样也无可厚非。那么有些疾病完全没有关联，也可能用一样的方子达到理想的疗效，这就比较让人称奇了。
比如中医常用的处方，张仲景的的“桂枝汤”，就有很多用处。最常用到这个方子的地方，是对外感风寒表虚证的治疗，表现为发热、恶风、汗出、头痛、干呕、肢体疼痛、脉缓，就可以应用桂枝汤治疗。因为桂枝汤的证型里面有头痛、肢体疼痛的症状，对于一些神经性头痛、肩周炎的患者，应用“桂枝汤”仍然可能获得疗效。然而“桂枝汤”其实临床用处非常多，比如汗证，有的汗证表现为营卫失和的证型，就可以应用桂枝汤治疗。“桂枝汤”用于治疗高血压病，可能也会有效果。如果高血压病表现为风寒外束肌表的症状，应用“桂枝汤”治疗后血压很快就能够平稳下来，当然，这还需要中医医生辨证用药，也就是“治病必求于本”。有经验的中医师将“桂枝汤”辨证加减运用于各种疾病的治疗，效果堪称神奇，其中奥妙，很难能够一言而尽。
那么，什么是“同病异治”呢？比如同样是慢性胃炎，有的人表现为寒邪客胃，恶寒喜暖，得温痛减，遇寒痛增，这时候需要应用散寒止痛的方法，可以选择良附丸加减。有的人表现为肝胃郁热的证型，胃脘灼热疼痛，烦躁易怒，口苦口干，舌红苔黄，脉弦数，可以用疏肝泄热的方法，可以选择化肝煎、左金丸，治疗用药可能完全不同。中医发展了几千年，历代医家都有自己独特的临床经验，每个人治疗疾病的理论和方法，也不尽相同。
比如同是眩晕病，《黄帝内经》认为“诸风掉眩，皆属于肝”，后世诸多医家秉持着祛风平肝、平肝潜阳、养肝柔肝的方法；朱丹溪则认为“无痰不作眩”，应该治痰为先；张景岳则认为“无虚不作眩”，治疗上应以“治虚”为主；然而，其实东汉医家张仲景，对于眩晕治疗见解颇多，其所创的经方，在治疗眩晕病方面疗效卓著，后人很多也热衷于研究张仲景的经方在临床的应用。所以，“异病同治、同病异治”很多时候也可以表现为学术争鸣。中医学术上的百花齐放、百家争鸣，对于中医的发展，也起到了很好的推动作用。